Добрый день.
Цитата: Можно дополнительно заявить еще один вид деятельности, который будет облагаться УСН (например, какой-нибудь вид услуг), чтобы не получилось, что по одному виду деятельности и УСН и ЕНВД.
Это ни к чему, если одинаковые виды деятельности ведутся в разных муниципальных образованиях (см. Письмо Минфина от 20 декабря 2012 г. N 03-11-06/3/89).
Цитата: То есть я правильно поняла, что мы можем в СПБ встать на учет как плательщик ЕНВД и уже работать спокойно по обуви и т.д..
Правильно.
Цитата: А указывать еще один вид деятельности нужно в Москву ехать, В ту же налоговую где регистрировали ИП?
Заявление можно и почтой выслать, но только в случае объективной необходимости.
Цитата: И выбрав вид услуг, мы не будем его предоставлять,как учитывать?
Лишние коды регистрировать не нужно.